O aeroporto regional de Jericoacoara está localizado em Cruz, um município vizinho a pouco mais de 30 km da vila de Jeri.
Durante a baixa temporada, Jericoacoara é servida por voos diretos das seguintes cidades: São Paulo (Guarulhos, pela Gol e Latam), Campinas (pela Azul), Belo Horizonte (pela Azul) e Brasília (pela Gol). Durante o verão, outras rotas diretas devem ser adicionadas.
Voos regionais: Fortaleza, Parnaíba, Barreirinhas e Canoa Quebrada
Voos regionais são oferecidos pela VoePass (ATR), que opera voos diretos entre três destinos da Rota das Emoções: Fortaleza, Jericoacoara e Parnaíba, utilizando turboélices ATR72 com 70 lugares. Fora do verão, a rota é operada três vezes por semana, entre Fortaleza, Jericoacoara, Parnaíba e Teresina, nas sextas, domingos e segundas-feiras. Os tempos de voo são: Fortaleza-Jericoacoara: 55 minutos, Jericoacoara-Parnaíba: 40 minutos e Parnaíba-Teresina: 50 minutos.
A Azul (Embraer) voa entre Jericoacoara e Parnaíba duas vezes por semana, com aviões a jato Embraer, às segundas e sextas-feiras. O trecho faz parte da rota triangular entre Campinas, Parnaíba e Jericoacoara, por isso é feito em jato, levando 45 minutos.
A Azul Conecta opera uma rota panorâmica por todo o litoral do Ceará, Piauí e Maranhão, utilizando aviões turboélices Cessna Caravan de 9 lugares, ligando Canoa Quebrada, Fortaleza, Jericoacoara, Parnaíba, Barreirinhas e São Luís. Depois de um início diário, a rota vem sendo operada 3 vezes por semana. Os tempos de voo de/para Jericoacoara são: Jericoacoara-Parnaíba: 1h30 e Jericoacoara-Barreirinhas: 2h (com escala em Parnaíba). O tempo de voo de Fortaleza-Jericoacoara é de 1h05.